Yo entiendo que tengas preocupación. A mi me pasó lo mismo al dar el dichoso salto a CSS.
Es como todo. Pasa por acostumbrarse. Vas cogiendo soltura y llegará un momento que te parezca mucho más fácil estructurar una página con hojas de estilos a tener que hacerlo con tablas. Al menos a mi me pasó así.
Y si que merece la pena. Vas a tener algo mucho más limpio, que carga más rápido, más cómodo de administrar, etc... Ésto sin contar que haces algo más profesional y acorde a la época.
Además, te quitas de en medio a los amigos rowspan y colspan.
