porque no te explicas mejor, dices que quieres paginar, pero la descripcion que estas dando es mas que paginas ordenar las imagenes en una tabla de 3 x 3, paginar las imagenes es lo mismo que paginar una basde de datos, si las abres directamente desde la carpeta o si tienes guardada la ruta en una base de datos, la forma es la misma, es cosa de adaptar el codigo un poco, con respecto a como poder ordenarlas, debes usar dos cilcos, algo parecido al metodo burbuja
Código PHP:
echo '<table border=1>';
for($i = 0; $i < 3; $i++) {
echo '<tr>';
for($j = 0; $j < 3; $j++) {
echo '<td>'.$imagen1.'</td><td>'.$imagen2.'</td><td>'.$imagen3.'</td>';
}
echo '</tr>'
}
echo '</table';
Esa es la forma de hacer la tabla de 3 x 3
Saludos