A ver, has cogido los 3 mas jodidos. Mozilla es Netescape y Gecko, IE es el chico especial, y Chrome (que es clavadito al safari) es del mismo sistema que los de apple, ahora no recuerdo como se llama.
IE tiene problemas interpretando los márgenes, especialmente los negativos. Mozilla nunca me dio problemas salvo por algunos caprichos (como contentDocument en javascript). Chrome simplemente lo toco al final, por si las moscas, pero parece ser que nunca he encontrado nada raro, si funciona en Firefox, funciona en Chrome (ya Safari me dio una vez problemas). Luego el Opera le voy haciendo filtros para las cosas que no entiende (que solo me ha ocurrido una vez).
El IE8 tiene muchas mejoras respecto de los anteriores. Los anteriores no entienden position: al igual que el resto. De hecho usan un sistema propio. Los márgenes negativos no los entiende.
Hay que hacer filtros en CSS para que lo entienda IE6 y demás.
Cita: Para darle más chicha al asunto, cuando uso el firebug en las dos páginas para ver si encuentro el problema el <div id="wrapper"> en el index.html no me lo detecta (es decir no me lo marca en azul) y en presentacion.html si me lo marca.
Mira a ver si tiene altura 0. Es muy común si usas todo en float y no pones el <div style="clear:both"></div> o si usas Posiciones absolutas.
Aún así pon imágenes.