para ello tienes la funcion mysql_query() que envia codigos al servidor mysql y devuelve la respuesta de este, pero para trabajar con mysql, o con cualquier motor de base de datos debes usar el lenguage SQL que es el que las bases de datos entiendes, PHP solo te proporciona una manera facil de conectar con ella y enviarle y recivir cosas, pero para hacer que esta funcione debes usar SQL, que no es lo mimso que php
por ejemplo, si tienes una tabla llamada usuarios, y quieres consultar todos sus campos debes hacer lo siguiente
Código PHP:
mysql_query('SELECT * FROM usuarios');
esa es la forma mas sencilla de una consulta, porsuepuiesto puedes escoger celdas en especiales, e incluso con condiciones
Código PHP:
mysql_query('SELECT nick, nombre, email FROM usuarios WHERE id = 2');
ese es un ejeplo un poco mas completo
para ello debes consultar manuales de SQL, ya que en PHP no los encontraras
Saludos