Tengo problemas similares con un div absolute con coordinadas definidas. La razón por la cual lo tengo así es porque ese div lo estoy utilizando como background para simular un modal dialog.
CSS
#main-content {
padding: 15px 10px;
margin-bottom: 5px;
height: 100%;
}
#slideshow_bg {
position: absolute;
top: 0px;
left: 0px;
min-height: 100%;
width: 770px;
background: #333;
opacity: 0.5;
filter: alpha(opacity=50); /* IE's opacity*/
}
* html #slideshow_bg {
height: 100%;
}
todos los "padres" de main-content tiene a su vez definido height: 100%
HTML
<div id="main-content">
<h1>Gallery</h1>
<div id="slideshow_bg">testing</div>
<div jsId="imageItemStore" dojoType="dojo.data.ItemFileReadStore" url="images.json"></div>
<div id="gallery" dojoType="dojox.image.Gallery"></div>
</div>