Estas cargando solamente framework de js "prototype", digamos que es el motor que interpretara las instrucciones del lightbox, pero te falta cargar tambien el js de este ultimo, tal vez tambien los estilos que requiere; ejemplo:
Código:
<link rel="stylesheet" href="css/lightbox.css" type="text/css" media="screen" />
<script src="ligthbox/lightbox.js" type="text/javascript"></script>
Si estas usando la version 2.0 tal vez te falten algunas otras cosas adicionales, para mas info:
http://www.huddletogether.com/projects/lightbox2/