Hola, no se de que forma se genera el código html con el CuteNews pero sería dándole un par de clases a los elementos <li> en modo alternativo.
Código:
<UL id=articles>
<LI class=even><A style="DISPLAY: block"
href="urldelanoticia"><IMG id=image alt=* align=left
src="imagendelanoticia">
<B>{title}</B><BR>{short-story}<BR
style="CLEAR: both"></A></LI>
<LI class=odd><A style="DISPLAY: block"
href="urldelanoticia"><IMG id=image alt=* align=left
src="imagendelanoticia">
<B>{title}</B><BR>{short-story}<BR
style="CLEAR: both"></A></LI>
</UL>
Ahora a las clases 'even' y 'odd' les das el color de fondo que quieras.
Salud!