primero si tienes los swf en otra carpeta es un problema de rutas para que no tengas problemas coloca en los codigos de carga la ruta completa acia el archivo que vas a cargar por ejemplo
http://www.miweb.com/carpeta/miarchivo.xml
y si el xml tiene como valores de carga sin la ruta completa añadirlos también ejemplo
<contenido>
<img> http://www.miweb.com/carpeta/img1.jp</img>
</contenido>
es lo mas sencillo que puedes hacer es un poco engorroso XDXD otra solución es mas complicada de explicar si no sabes mucho de programación XDXD