Hola:
Podés hacer ambas cosas, es decir, tener tu web y dentro de ella el foro: ej.
www.tuweb.com y
www.tuweb.com/foro/ y también podes redireccionar al visitante a tu foro en otra direccion o subdominio: ej.
www.tuweb.com y
www.foro.tuweb.com
Creo que la desición pasa por la organización de tu proyecto y el tamaño y trafico del foro que montarás.
Saludos.