Esperaba dar una solucion mejor, tanto por mi como para el resto, de ahi que no comentase la solucion actual, simplemente saque las paginas a las que enlazaba el boton de flash de las carpetas donde las guardaba, y las coloque en el raiz, cambie los enlaces de nuevo en el boton flash para que apuntaran a la nueva ubicacion, y asi quedo funcionando..............
en fin, sigo buscando el por que se van de fiesta los enlaces en Firefox cuando enlazo dentro de carpetas.