Que estés queriendo cambiar solo un texto dentro de una función de JS no es buena señal. ¿Por qué no puedes resolverlo desde JS?; ¿Cuál es tu condición que necesitas de PHP?
Que manejes un archivo PHP tampoco es buena señal. Puedes construir JS dinámico y colocarlo en línea o cachar tu código. Zend_View tiene helpers para ambos métodos.
Mirá por acá a ver si te da alguna idea:
http://framework.zend.com/manual/en/...ial.headscript