Hola,
Perdon, pero ¿que tiene esto que ver con PHP?
¿Has probado a acceder directamente a la URL de la imagen? ¿Estas usando un script PHP para mostrar la imagen (pe, <img src="miimagen.php?id=2? ¿Te pasa lo mismo con otros formatos? ¿Sabes si se envian bien las cabeceras MIME? ¿No sera que el .bmp se ha corrompido al subir (prueba a bajarlo y visualizarlo en tu navegador en local)? ¿No estaran en un formato BMP no soportado por los navegadores (creo que los navegadores no soportan algun sistema de colores, como el CMYK)?
Suerte.