Hola burningman
Ante todo, las cosas por su nombre. No hablamos (ni vamos a hablar) de encriptar URLs.
Lo que tu caso expone es (y así lo entiendo) que tanto http://www.sgrfisioterapia.com/index.html como http://www.sgrfisioterapia.com/ muestran el mismo contenido y por lo tanto, de cara a los motores de búsqueda es contenido duplicado.
En tu caso, debieras editar el archivo .htaccess y agregar lo siguiente:
Código txt:
Ver originalRewriteEngine on
Options +FollowSymLinks
RewriteCond %{THE_REQUEST} ^.*/index\.html
RewriteRule ^(.*)index.html$ http://www.sgrfisioterapia.com/$1 [R=301,L]
@Ryo lamentablemente no entiendo lo que querés decir
