Dice la DRAE, que pila, a parte de otras cosas, significa:
Cita: 1. f. Montón, rimero o cúmulo que se hace poniendo una sobre otra las piezas o porciones de que consta algo
Pila se aplica entonces a tcp/ip por su estructura en capas o niveles.: aplicación, transporte, red, enlace y fisica, cada uno de estos niveles o capas con sus respectivos protocolos. Se refiere también a como funciona la transmisión de datos de una capa a otra, headders, etc para transmitir información desde una máquina a otra.