Hola,
 
Deben existir formas mas sencillas, pero este te da el resultado para todos los usuarios  
Código:
 
SELECT flujo,usuario,SUM(valor) 
FROM flujos 
WHERE (flujo,usuario) IN 
                     (SELECT flujo,usuario 
                     FROM flujos 
                     WHERE fecha IN 
                               (SELECT  MAX(fecha) 
                               FROM flujos 
                               GROUP BY usuario) 
                     GROUP BY flujo,usuario ) 
GROUP BY flujo,usuario
  Muchos group by, pero debe haber algo mas simple, solo que lo hice al instante. Funciona 
 
 
Saludos y suerte.