fpdf en Segundo Plano

[xalo]

Generalmente no posteo. Pero ahora no tengo otra opción.

Genero un PDF con FPDF que tiene imágenes y cuadros. Aproximadamente de 700 paginas, en el localhost todo va bien, pero cuando lo subo al hosting (godaddy) pues se demora generandose y me arroja error. Que he intentado:

1. En el Script le coloque
ini_set('memory_limit', '100M');
ini_set('max_execution_time','1000');
ini_set('max_input_time','1000');
pero nada. (Si tienen razon soy exagerado.. pero quería que sobrara).

Creo que lo correcto seria hacer que el script ponga a correrlo del lado del servidor, pero como se hace eso? con ello generaria el fichero del lado del servidor y desde acá puedo linkearlo. Cabe anotar que hago otros reportes mas pequeños que corren bien. (180 a 200 paginas)