La solución está en el momento de guardar el archivo, coincidiendo con el metatag especificado. No es necesario codificar ningún caracter como ñ o á.
Si guardas con ANSI, el metatag debe ser iso-8859-1. Si guardas con UTF-8, el metatag debe especificar utf-8.
He creado este artículo hace un tiempo para ayudar en este famoso problema, con su debida explicación.
http://www.documentoweb.com/ISO-8859...-de-caracteres
Saludos.