Hola Ricardo, tanto tiempo,
yo me acuerdo que sólo ejecuté el install del PHP y se instaló solo en win98, al principio me dio un error acerca de la seguridad de CGI, y había que deshabilitar no se qué cosa para que funcione.
No recuerdo exactamente qué era, pero se configuraba en el php.ini. Luego de eso funciona lo más bien. Tal vez si señalas qué error es me acuerde.
También recuerda darle permisos de "EXECUTE" al sitio en PWS.
Saludos