Yo ultimamente estaba probando para windows el GUI (o Frond End como lo quieran llamar): SQLyog ... Como decia tambien permite la conexión simultanea a dos BD una Mysql y otra via ODBC ..
El caso q lo probé porque dice hacer un "update" de dos servidores mirando si se ha actualizado algo por aquí o por allá .. No me convenció mucho ..pero si no se prueba no se sabe xD .. El Mysql Front end es mas comodo de usar y casi las mismas funciones ..
Si quieren un GUI bueno .. (y tienen unos cientos de $$$$):
www.mysqlstudio.com www.mysqlmanager.com
Son tan buenos como caros xDDD
Un saludo,