No, porque ASP se ejecuta en el servidor mientras que JavaScript corre en el cliente, para el momento que muestras tu confirm, el comando ASP ya se ejecutó, lo que necesitas hacer es poner el confirm en tu link:
Código:
<script>
function confirmar_eliminar{
return confirm('Realmente desea eliminar el registro?');
}
</script>
<%
while (not RS.Eof)
%>
<tr><td> <%=RS("USU")%> </td>
<td><a href='borrar.asp?USU="<%=RS("USU")%>" onclick="javascript:return confirmar_eliminar();">ELIMINAR</a></td></tr>
<%
RS.MoveNext
wend
%>
Saludos