Instala la última versión de Apache 2.0.45 .. No sé que versión en concreto estas intentando instalar .. pero la 2.0.44 tenia un "bug" en
Win95/98/ME Patch: apache_2.0.44-win9x-x86-apr-patch.zip [PGP] [MD5]
Ahora ya no está ese parche .. pues salió la nueva versión ..
http://httpd.apache.org/download.cgi http://httpd.apache.org/docs-2.0/platform/windows.html
Y .. bueno para windows 98 funciona mejor Apache 1.3.x sobre todo si no vas a correr Apache como servicio ..
Un saludo,