Flv player parece la mejor opción, aunque sin duda alguna el mejor reproductor es vlc player en su versión 1.1.3 que es la que yo tengo instalada:
http://vlc-media-player.programas-gratis.net/
Activar los filtros y codecs tambien puede ser una solución, por ejemplo, de tener el klite codec pack, ponte el codec pack de elisoft, puede que te sea más util. No hace falta que utilices obligatoriamente el windows media player ya que es el peor reproductor que conozco, junto con el winamp, sobre video es el peor.