Hola,
Quizas me matas (o te suicidas), pero ¿te has fijado que en los links llamas a la pagina index.php? Es mas,
http://www.lynares.com/index.php no existe. Creo que lo que querias poner en los links es la pagina webmodular.php que es la que carga los include(), y que normalmente es la index de un sitio. Para solucionar esto y que no tengas que cambiarlo cuando renombres webmodular.php a index.php , puedes usar la variable de servidor $_SERVER['PHP_SELF'] que contiene el nombre de la propia pagina.
Saludos.