ocultar divs que estan dentro de otra

[sanxuan]

Hay dos propiedades CSS que pueden hacer desaparecer una capa.
Usando display:none y display:block haces desaparecer la capa reajustándo los elementos de ésta en caso de que haya elementos flotantes, divs que se adaptan a su contenido etc...
Usando visibility:hidden y visibility:visible se consigue que aparezcan y desaparezcan sin que se modifique la composición de la página como en el caso anterior.
Otra posibilidad aún no soportada de manera uniforme en todos los navegadores es la opacidad que daría el mismo resultado que visibility.
Supongo que tu javascript hace uso de alguna de estas propiedades para ocultar las capas ( o lo que sea).
El problema debe de estar seguramente en los parámetros que le pasas a tu función, comprueba que el selector hace referencia a la capa hija.
Si pones un enlace a tu página o colocas HTML, CSS y la función javascript podremos concretar más. Basta con incluir las partes necesarias para observar el problema.