Compadre onchange sólo te servira a uno , pero si lo llevas al where no es necesario que lleve todas las condiciones , podrias jugar con lo que recibes y desde ahi realizar tu consulta de forma dinámica, por ejemplo si recibes tres selects con datos, creas un contador de selects no vacios, luego tus selects los puedes pasar a un array y recorrelo mientras generas las condiciones en el where
ó utilizar un || en vez de and en el where