Recorrer dos array a partir de otro como base

[Nano_]

Saludos

Se me ocurre que podrias hacer un count inicialmente sobre $calculoP y $calculoA. Algo de la siguiente manera:

Código PHP:

$contAuxHP     = count($calculoP); // Conteo horas de Proyetos
$contAuxHA     = count($calculoA); // Conteohoras de Actividades 
for ($i = 1; $i <= count($encabezado); $i++){ 
 
               $semana= $encabezado[$i][0]; // semanaActual
               $anio = $encabezado[$i][1]; // añoActua
 
               $auxMes = obtenerNumMesDeSemana($semana, $anio); 
              if($contAuxHP<=$i)                      
              $auxHP     = $calculoP[$i]["Horas"]; // horas de Proyetos
              if($contAuxHA<=$i)  
              $auxHA     = $calculoA[$i]["Horas"]; // horas de Actividades      
 
             // escribo para cada iteración, el mes, las horas de proyectos y las horas de actividades
               echo "<tr>";
               echo "<th>$auxMes</th>";
               echo "<td>$auxHP</td>";
               echo "<td>$auxHA</td>";
              echo "</tr>";
 
        }