Darte una respuesta sin ver algo de codigo esta complicado. ¿has andidado los marcos unos dentro de otros? por ejemplo
<div class="principal">
<div class="izquierdo"> contenido de uno </div>
<div class="derecho"> contenido de otro </div>
</div>
revisa las clases y el parametro float y position a ver si estan hay los fallos.