Lo que tienes que buscar son herramientas del Tipo CASE Studio, que hoy fue reemplazado por el
TOAD Dat Modeller, porque la parte de herencia del modelo E-R no está en el modelo físico (tablas) sino en el modelo lógico (entidades).
Esto sería un Modelo Lógico ERD:
y esto el Modelo Físico ERD:
El MySQL Workbench sólo trabaja con modelos físicos.
Por otro lado, el LMERD no se utiliza si trabajas con UML, por lo que debes definir bien cómo vas a analizar y diseñar tu sistema.
Por su parte, no conozco ningún software que por sí mismo pueda definir el diseño de una base aplicando las Formas Normales, especialmente desde el momento en que estas tienen criterios algo subjetivos desde cierto punto de vista. Digo esto último porque un software no puede definir ni analizar los dominios de los atributos en el contexto de un sistema basado en reglas de negocio, relevadas y expresadas en lenguaje natural. Hay puntos donde la acción de las personas es inevitable
Personalmente te recomiendo aprender a normalizar. Es mejor que dejarle la tarea a un soft, al menos hasta ahora.