no estoy seguro pero creo que esa posiblidad no existe dentro del servicio de w3.org. y tiene sentido porque al ser un servicio público, facilmente el servidor podría sobrecargarse con muchos usuarios intentando validar toda una web. quizas lo que puedas hacer, pero muy fácil decirlo que hacerlo, es bajarte el software de validación que utiliza w3.org, instalarlo en una máquina personal, reconfigurarlo si es que tiene la capacidad, o escribir el script necesario para poder generar multiples reportes de multiples páginas. en el caso particular de unicorn no se si esta disponible para descargar el script, pero recuerdo que alguna vez habia visto el validador html disponible para descargar y estaba escrito en perl. es cuestión de investigar.
