Asesoramiento configuracion para compatibilidad

[Honolulu]

Hola!

Tengo unas dudas acerca de la mejor opción para hacer que un proyecto no sufra cuando se actualicen módulos.
El caso es que es un site muy grande que utiliza mucho módulos.
Cómo todos sabréis cuando necesitas que 2 módulos sean compatibles entre si, o hagan exactamente lo que necesitas, aplicamos un parche y a correr.
Pero.. ¿que sucede con los updates?
Por ejemplo tengo parcheado el módulo views para eliminar los resultados duplicados cuando hay múltiples fechas en un campo cck date.
Si activo la actualización de dicho módulo, cuando haya un update, que seguramente no incluya este parche, perderé lo que había conseguido.
Me da miedo también que durante una update del core, por ejemplo actualicen la libreria jquery y se me vaya al traste lós módulos que utilizan jquery del core.
¿que debo hacer? ¿quito los updates de los módulos parcheados?
Mil gracias,