@andres es logico no saber el como, si el manual de Zend 2 es un chiste(y malo), toda la parte de di es manipulando objetos, y no tiene nada para hacerlo desde config.
@GatorV, no lo he probado, pera la idea de setDefaultViewPartial es no llamar a paginationControl, que pasa si haces ?:
Yo creo que ese paginationControl hace trampas :P