Si la session del servidor remoto la abres en tu maquina solo es cuestión de poner el path al fichero... es decir si anrtes de llegar al prompt de mysql estas dando la direccion o ip del servidor remoto, en realidad esa consola esta en tu maquina aun que apunte al servidor remoto... no se si me explico.
Aqui quizas se explican mejor
http://www.desarrolloweb.com/faq/res...tos-mysql.html
Si quisiéramos recuperar el backup en otro servidor, también lo podríamos hacer con la línea de comandos de MySQL, pero mediante una sentencia que incluya el host al que nos queremos conectar:
mysql --password=tuclave --user=tuusuario
-h 192.168.1.134 basedatos < respaldo.sql
192.168.1.134 ip del hsot remoto