el include_once solo sirve para php y no para javascript, por lo tanto no te servira.
yo por lo general mando una variable por post, get o por session para decirle a la pagina que cargue un js de mas o un js menos y asi evito cargar mas de uno.
por experiencia se que hay ocaciones en que los desarrolladores de librerias js usan el mismo nombre para varias funciones y alli es cuando doto se viene abajo.
usa la consola de depuracion
Console2 para ver donde se cae y por que.