Meramente casi así es en Code Igniter (viendolo ahora ya no me gusta mucho que digamos la forma en que trabaja Code Igniter, pero para iniciarte en un framework mvc esta bien).
Ando viendo si creo un sitio para subir algunos de los tutoriales que no he terminado (incluyendo el desarrollo de un framework), entre ellos uno de Code Igniter.
OJO: A la función $this->load->view debes llamarla algo así:
Código PHP:
$this->load->view('templates/header', $variables);
$this->load->view('news/create');
$this->load->view('templates/footer');
Fijate bien en la ruta colocada, ya que debes tener siempre en claro que vistas son parte de un template y que vistas son realmente parte del contenido.
Repasando rápidamente un MVC (pero solo v y c); el controlador servirá para definir el contenido que será mostrado (haciendo procesos, consultado db a través de un modelo, etc) y la(s) vista(s) definen cómo será mostrado dicho contenido (semánticamente hablando). En resumen Controlador=Define Contenido, Vista=Muestra el contenido.
No olvides que el HTML que generará tu vista es meramente estructura de como presentar información, y el CSS es el diseño/estilo que darás a la información.