Hola, pone tu código mejor.
A que te referis con "chequearla en un query"? si existe en la tabla? eso podes hacerlo con mysql_num_rows haciendo un select de matricula en tu tabla donde la matricula sea igual a la matricula que recibis por el form. 
algo asi 
asumiendo que usas metodo post y que el valor en el atributo name de tu input es 'matritula' entonces:   
Código PHP:
Ver original$matricula = $_POST['matricula'];
$sql = "select tucolumna from tutabla where tucolumna = $matricula";
 
 
echo "La matricula existe en la base de datos";
}else{
echo "No existe";
}
  
pero como te dije pone tu código y explicate mejor que no me cierra mucho