Obviamente, la primera fuente
http://www.sqlite.org/
En este curso
http://www.mclibre.org/consultar/php/index.html
tenes muy buenas referencias y está bien explicado (al final hay un apartado que dice obsoleto, pero leelo igual, también la sección bases de datos
El sitio de php tambíen, por supuesto
http://www.php.net/manual/es/book.sqlite.php
y finalmente podés descargarte y/ instalar estas 2 aplicaciónes
http://freecode.com/projects/sqlitemanager (está hecha en php y hay que instalarla en un server)
y esta extensión para firefox
https://code.google.com/p/sqlite-manager/
Con eso tenés más que suficiente para arrancar
Te sugiero que pidas muevan este post a web general ó php quizás, porque es más apropiado
Saludos