Me estás confundiendo con lo que ponés.
S e lcheckbox corresponde a cada fila. no tenés que crear $chk, lo ponés todo en los contenidos
Código PHP:
Ver original$contenido_izq .= $fila['nom_categoria'] . '-' . $fila['clasificacion'] . '<input type=\'checkbox\' name=\'opcion\' value=\'\'';
lo mismo para le derecha
Saludos