conexion bbdd en modelo o controlador?

[masterpuppet]

Inicializarla en un controlador es muy mala idea y en un modelo depende un poco del patrón que estés utilizando, de todas formas en Zend 1 no es necesario inicializar la conexión en el bootstrap simplemente configura el resource y el fw hace el resto(lazy loading) y si estas con Zend 2 basta con setear el config y hacer la llamada desde el locator.

Talves si muestras algo de código se te pueda hacer alguna sugerencia.

Saludos.