Si sirve solo tienes que modificarlo, y disculpa pero entendí mal tu duda.
supongo que el banner tiene un URL a donde te va a mandar a la pagina del cliente.
EJ.
creas el archivo del contador por banner en este caso de ej banner1.txt con un 0 escrito.
en INDEX.php
<a href="contador.php?id=banner1&url=http://cliente.com"><img src="banner1.jpg"></a>
en CONTADOR.php
$contador = 0;
$fp = fopen($_GET['id'].".txt","r");
$contador = fgets($fp, 26);
fclose($fp);
++$contador;
$fp = fopen($_GET['id'].".txt","w+");
fwrite($fp, $contador, 26);
fclose($fp);
$url = $_GET['url'];
header("Location: $url");
asi es como lo hacen muchas paginas