Hola ! mira, hay otras formas de hacer que un texto parpadee, recientemente vi un post de
VisualIdiot, un maestro en javascript y css, el cual en
este post muestra como aplicar un efecto blink mediante css.
ahora, para hacer que solo parpadee cuando el mouse no se encuentra sobre el elemento, le agregamos un pequeño fix de hover, y resuelto !
el ejemplo esta aca :
http://jsfiddle.net/xTnxv/