La idea es que tus viejos enlaces los actualices como deberán verse finalmente, dichas reglas no hacen el cambio por arte de magia, pon atenciñon ahí.
Código PHP:
Ver original// ANTES
<a href="x.php?y=<?php echo $z; ?>">Link</a>
// AHORA
<a href="x/<?php echo $z; ?>">Link</a>
¿Se entiende?
