a ver si te sirve (recuerda que el usuario con el que crees los permisos de la carpeta/archivo debe tener más privilegios que el usuario que va a acceder a la carpeta/archivo)
http://www.desarrolloweb.com/articulos/2311.php
y para los permisos apache por si quisieras configurar los permisos de las carpetas de apache, aunque en un principio no te haría falta
http://shib.ametsoc.org/manual/es/howto/auth.html