No borrar con variable vacia su valor previo en una bbdd

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Lo único que se me ocurre para que sea mas "compacto" es que metas los valores en un array y después lo recorras haciendo la comprobación siendo la estructura así:

$Valores = Array con los datos;
$Consulta = Lo que te puse antes para montarla
$ContadorComa = 0;
Recorre $Valores{
ContadorComa = + 1
Compruebo si el valor tiene datos, si lo tiene le agrego a la consulta sino pues no meto nada mas.
compruebo si el contador de la coma es igual al numero total de registros, si es menor le agrego la coma a la consulta.
}
$Consulta .= El final de la consulta con el WHERE

Te he puesto lo que sería la lógica para hacerlo, faltaría codificarlo bien para ponerlo en marcha.