Si ese tag HTML lo tienes incrustado en HTML .. debes de hacer "echo" a las variabels que requieras para que se "propagen" al iframe en la llamada a la página que haces en el src ...
Código PHP:
<iframe frameborder="0" height="100%" width="100%" scrolling="yes" src="../../whois_info.php?dom=<?echo $dom; ?>&tipo=<? echo $com; ?>&aclass=popup">
Un saludo,