Vaya, pues en menudo lio te has metido...
Creo que no te quedará de otra mas que cambiar todas tus etiquetas de entrada por <?php
Esto debería quedar como escarmiento público para todos los que nos ahorramos algunos caracteres durante nuestra programación, pues este caso en particular (el trabajo con archivos xml) nos deja ver que si queremos hacer código que sea facilmente escalable, debemos ceñirnos a los estandares del lenguaje PHP como lo marcan los libros.