Cita: lamentablemente en mi caso estoy con un sistema que ya funciona de esa forma guardando tildes y eñes.
SI las guarda, el sistema está
bien diseñado. Lo que TU debes hacer es programar correctamente para que las consultas lleguen bien a la base, y la base pueda interpretar correctamente los caracteres extendidos.
Me parece que estás mirando el problema desde el lado equivocado. Lo mal que haces es quirar algo que en realidad deberías estar enviando. En todo caso tu conexión y tu manejo de la construccion de la consulta debe estar mal hecho.