Hola,
Gracias por la respuesta. Pues lo he comprobado que el 301 era correcto con diferentes herramientas y todos dan ok. He utilizado herramientas como
http://www.seoreviewtools.com/redirect-checker-tool/
¿qué puedo hacer? A mi se me ocurren dos ideas;
-Quitar el plugin y las urls limpias
-Desindexar la viejas urls
¿cómo lo veis?
Gracias!