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Iniciado por Zeokat 
Se que no te voy a responder a tu pregunta, pero si voy a escribir una pequeña reflexión. Antes también me apoyaba en el servidor DNS de WHM (cPanel) pero al final decidí dejar de usarlos.
Como el servidor es para uso personal, me ahorro un consumo de RAM y CPU al emplear el servidor DNS que mi proveedor me facilita o incluso el de CloudFlare. Pero claro, esto ya va según gustos y recursos disponibles, yo soy de ahorrar siempre que se pueda jeje
Yo también haría eso lo que pasa es que yo tengo varios clientes en mi servidores y por cada subdominio que ellos quieran hacer yo tengo que crearles la entrada en Route 53 y es bastante molestoso.