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Iniciado por Libras 
Si son 2 tablas donde vas a guardar id's diferentes, entonces no tienes porque guardar el id en las 2 tablas, a menos que crees una tabla con los datos que comparten fisicas y juridicas y sobre esta pongas el id, ya los datos que son "exclusivos de cada tabla" entonces esos nada mas les pones el id a los que les corresponda, podrias poner un pequeño esquema de tus tablas?
Gracias por tu respuesta Libras! Adjunto una captura de 4 tablas de mi base, hasta ahora es una base de 42 tablas pero en cuestión son estas 4. Creé una tabla para clientes fisicos y otros juridicos porque hasta el momento de consultar no me daba la idea de cómo hacer. Pero me trabé cuando hay que hacer las facturas, de donde toma el cliente la misma....en lo que es facturas no puedo tener varias tablas ya que deben ir numeradas.
Saludos!