Yo tuve el mismo problema, en mi caso lo solucione porque estaba el problema en los archivos y en el xml que en ambos han debe estar todo sincronizado.
Pero por lo que investigue todo debe estar en la misma codificación, los archivos JSP, etc...el web.xml, el servidor web(tomcat u otro), la base de datos si es tu caso.
En mi caso las directivas de la codificacion fueron:
En los JSP:
Código:
<%@page contentType="text/html" pageEncoding="ISO-8859-1"%>
y en el archivo web.xml:
Código:
<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
<web-app version="3.1" xmlns="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee/web-app_3_1.xsd">
Ambos, si van en la cabecera.
Suerte